千手柱间作为火影忍者中享有忍者之神称号的角色，其忍术体系以木遁为核心，兼具攻防一体与战场控制能力。木遁·树界降临是柱间的招牌忍术之一，通过将查克拉转化为生命能量，瞬间制造大片森林覆盖战场，树木可自由操控进行攻击或防御，同时释放的花粉具有麻痹效果，能够有效限制敌方行动。该术在终结之谷之战中曾压制九尾与须佐能乎的联合攻击，展现了极强的范围控制力。
木遁·木人之术是柱间对抗大型目标的终极手段，召唤出的木人体积与完全体须佐能乎相当，具备徒手接住尾兽玉并反弹的物理强度。木人头部设有驾驶舱供柱间操控，配合仙术查克拉强化后，曾与宇智波斑控制的九尾正面抗衡且不落下风。此术在火影忍者究极风暴4中被评定为T1级技能，高手对决时常用于破除防御姿态。
仙术查克拉的应用是柱间战斗体系的核心优势，官方设定显示其能瞬间进入仙人模式，大幅提升忍术威力与恢复能力。配合木遁·花树界降临时，仙术查克拉可加速树木生长并增强毒素效果，形成持续性的战场压制。柱间的仙人模式疑似自主觉醒而非传承自湿骨林，这使其在查克拉量与恢复速度上远超常规忍者。
战术层面，木遁·皆布袋之术提供了极高的机动性，通过地面突袭的木质巨手实现多角度抓取，配合明神门（扦插之术强化版）可形成长达5秒的强制控制链。在手游火影忍者OL中，该组合能破除满级霸体效果，是决斗场反制的关键手段。而被动技能榜排之术赋予的异常状态免疫，则使柱间在面对幻术型忍者时占据天然优势。
终极奥义真数千手·顶上化佛作为木遁最强形态，需消耗多个奥义点发动，其破坏力随奥义点数量递增。在秽土转生状态下，该奥义可与二代至四代火影形成组合技，实现全屏范围的多段打击。根据实战测试，完整释放的奥义配合木龙之术追击，无暴击情况下可造成约250万伤害量，具备终结战局的战略价值。
